104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2763 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 
156 aa  116  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  43.8 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  47.33 
 
 
148 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  47.33 
 
 
148 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
169 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  47.37 
 
 
142 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  46.04 
 
 
142 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  39.42 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  45.65 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  41.91 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  43.88 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  40.46 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  39.23 
 
 
140 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  37.14 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  45.19 
 
 
135 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  45.19 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  37.78 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  34.33 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  42.16 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  42.16 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  35.56 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  47.87 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  34.81 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  36.57 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  36.3 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  36.3 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.43 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.43 
 
 
135 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
134 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
154 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  27.27 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  27.27 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  28.85 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  28.7 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  28.7 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  28.7 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  28.7 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  26.13 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  28.7 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  28.7 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  28.7 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  29.63 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.64 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  26 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  29.57 
 
 
139 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
131 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  26.25 
 
 
332 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  23.08 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  25.26 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30.3 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>