134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2864 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  77.99 
 
 		 168 aa  254  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  77.36 
 
 		 168 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  77.36 
 
 		 168 aa  253  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  73.58 
 
 		 167 aa  247  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  68.67 
 
 		 173 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  66.26 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 139 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  41.5 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  41.5 
 
 		 335 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  42.18 
 
 		 329 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 		 332 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  40.82 
 
 		 334 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  44.37 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  41.33 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 301 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  41.55 
 
 		 295 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  42.22 
 
 		 319 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 304 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  36.55 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  35.86 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  33.57 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  37.14 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 128 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  29.73 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  26 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.47 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  28.17 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  25.69 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  29.17 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  34.27 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  33.06 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  31.5 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  29.86 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  28.67 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  28.21 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  29.73 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  25.16 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  25.87 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  31.47 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  30.67 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  28.21 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  28.21 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.54 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>