69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0099 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 128 aa  266  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  41.6 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  43.44 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  44.26 
 
 		 329 aa  93.2  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 332 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  42.62 
 
 		 335 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  42.62 
 
 		 334 aa  90.9  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  38.52 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  36.59 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  35.2 
 
 		 301 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  38.02 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  33.09 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  29.75 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  31.45 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  30.5 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  31.01 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  31.5 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  28.71 
 
 		 169 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  26.13 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  26.13 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  25.74 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  25.74 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  25.74 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  25.74 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  28.71 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  32.14 
 
 		 162 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  26.73 
 
 		 165 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>