159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2722 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  98.29 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  98.29 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  97.71 
 
 		 175 aa  356  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  92.57 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  92.57 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  92.57 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  92.57 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  91.33 
 
 		 335 aa  331  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  87.2 
 
 		 165 aa  305  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  85.45 
 
 		 334 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  83.53 
 
 		 332 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  83.44 
 
 		 169 aa  295  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  80.86 
 
 		 180 aa  286  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  80.61 
 
 		 329 aa  280  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  80 
 
 		 168 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  52.56 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  54.29 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  50.69 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  52.03 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  45.86 
 
 		 178 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  44.22 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  39.55 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  38.64 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  37.88 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  37.59 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  42.22 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 319 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  38.97 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 144 aa  97.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  40.91 
 
 		 295 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  41.53 
 
 		 301 aa  94.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 304 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  37.1 
 
 		 167 aa  94  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  31.11 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  41.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.91 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  32.54 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.13 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  31.34 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  30.61 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.86 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.4 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  29.51 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  29.85 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 128 aa  51.2  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.29 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.13 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.62 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  28.03 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  28.36 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  29.57 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  28.03 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  23.38 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  28.97 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  27.2 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  26.72 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  30.19 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  25.69 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  31.17 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  24.22 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  28.44 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  28.44 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  28.44 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  30.26 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  28.44 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  24.14 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>