136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3505 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  77.92 
 
 		 188 aa  249  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  75.64 
 
 		 169 aa  247  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  73.68 
 
 		 160 aa  240  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  73.68 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  71.61 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  67.48 
 
 		 163 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  51.23 
 
 		 162 aa  167  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  46.48 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  44.12 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  43.23 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  43.87 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  40.43 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  39.72 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  40.43 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  39.72 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  39.72 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  39.72 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  36.3 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  35.81 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  34.9 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  36.17 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  34.53 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  34.53 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  34.76 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  37.4 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  37.4 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  37.4 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  32.87 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  32.87 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  32.87 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  29.93 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  30.57 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  33.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  27.86 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30.09 
 
 		 319 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 233 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  28.99 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  33.66 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  31.48 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  29.6 
 
 		 329 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  30.56 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  27.61 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  27.48 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  28.12 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  25.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  22.66 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  28 
 
 		 335 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  26.8 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  27.2 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  26.72 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  27.2 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  27.2 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  27.2 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  27.43 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28.35 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  30.15 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>