277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2356 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  75.94 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  53.79 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  38.06 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  38.06 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  31.85 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  32.5 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  29.14 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  30.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  35.94 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  29.45 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  28.46 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  28.46 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  31.13 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  38.94 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.81 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  28.68 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  27.69 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.89 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.54 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  36.14 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.69 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.69 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.69 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  34.94 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  26.73 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  25.37 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.73 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  26.73 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  31.53 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  26.73 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  26.73 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  32.73 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 175 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 175 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 175 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 175 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  24.49 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  30.19 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.69 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  31.13 
 
 		 335 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  27.34 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  28 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  27.62 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>