266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2516 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 135 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  53.79 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  35.94 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  36.92 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  28.45 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  29.1 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.32 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  27.07 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.55 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  24.06 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  25.52 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  25.56 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  26.21 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  23.48 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  33.04 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  25.56 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.56 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  25.38 
 
 		 334 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 304 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30.36 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  29.13 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  24.67 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  33.02 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  26.92 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  28.35 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  28.35 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  28.35 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  28.35 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  25.19 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  34.62 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  27.68 
 
 		 248 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  24.03 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  28.92 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.13 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 295 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  27.68 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  22.66 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  22.79 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  27.68 
 
 		 374 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  26.67 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  26.98 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  23.31 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  24 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.85 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.83 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  24 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  24 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  26.98 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>