234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2401 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 148 aa  292  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  52.31 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  47.83 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  48.39 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  48.39 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  48.39 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  48.82 
 
 		 238 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  45.16 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  48.03 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  48.03 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  48.03 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  48.03 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  48.03 
 
 		 248 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  48.03 
 
 		 374 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  47.58 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  42.31 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 		 213 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  42.75 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  38.14 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  41.53 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  40.18 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  37.3 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  34.96 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  33.09 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  39 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  35.59 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.88 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  35.04 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  31.51 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  37.08 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  33.63 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  33.63 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  33.63 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  31.4 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  35.96 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  26.97 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  39.76 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  32.48 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  30.07 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  26.97 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  31.5 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  31.11 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.62 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  36.96 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  37.11 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  37.62 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  31.06 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  31.78 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  31.06 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>