121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0904 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 137 aa  276  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  37.9 
 
 		 295 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  37.1 
 
 		 319 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 304 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  38.28 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  34.96 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  35.77 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  36.59 
 
 		 329 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 		 301 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 332 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  35.77 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  34.4 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  31.88 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  32.8 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.13 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  29.66 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  30.95 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  30.16 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  28.03 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  29.69 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  26.77 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  28.23 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  26.77 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 152 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  28.33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.53 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  29.66 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  30.89 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  24.81 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  24.81 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  24.81 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28.04 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  25.98 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.53 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  24.41 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  28.37 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  29.73 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.27 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  24.06 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  30.16 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  24.41 
 
 		 175 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  28.07 
 
 		 160 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  27.12 
 
 		 148 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>