111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2721 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  94.34 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  94.34 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  94.34 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  97.2 
 
 		 165 aa  296  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  97.2 
 
 		 165 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  87.88 
 
 		 165 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  97.2 
 
 		 165 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  93.29 
 
 		 335 aa  294  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  87.5 
 
 		 168 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  88.81 
 
 		 332 aa  275  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  81.65 
 
 		 334 aa  274  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  81.58 
 
 		 155 aa  270  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  81.7 
 
 		 154 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  84.25 
 
 		 147 aa  269  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  84.14 
 
 		 329 aa  266  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  60.14 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  56.74 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  56.03 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 		 148 aa  183  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  52 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  43.66 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  40.43 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  40.14 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  34.84 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  34.29 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  40.65 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  38.76 
 
 		 301 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 		 295 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 128 aa  94  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 304 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  36.75 
 
 		 319 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.24 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.12 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  30.22 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  24.24 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  25.19 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  29.2 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  29.2 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  29.2 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  24.43 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.42 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  23.66 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.68 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  24.62 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  19.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  26.4 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  25.6 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  29.58 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  23.7 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  30.61 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  27.01 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  27.01 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  27.01 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  22.79 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  26.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  24.75 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  24.82 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  23.7 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  27.27 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  23.85 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  30.61 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  27.13 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 158 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  25.2 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  25.58 
 
 		 154 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  25.58 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>