231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2790 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  100 
 
 
199 aa  291  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  100 
 
 
139 aa  290  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  99.28 
 
 
139 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  98.56 
 
 
139 aa  287  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  61.07 
 
 
142 aa  167  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  51.15 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  51.91 
 
 
139 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  58.33 
 
 
139 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  58.33 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  56.67 
 
 
139 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  48.84 
 
 
143 aa  136  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  46.38 
 
 
143 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
153 aa  126  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  47.79 
 
 
139 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  54.13 
 
 
141 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  36.75 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  32.31 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  33.62 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  42.22 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  37.78 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  43.02 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  43.02 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  43.02 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  43.02 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  29.27 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  30.14 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  35.59 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  28.93 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  28.93 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  28.93 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  31.03 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  31.03 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  28.07 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  25.93 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  38.27 
 
 
132 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  28.07 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  28.07 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  28.07 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  28.07 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  28.07 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  37.5 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  28.97 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  29.41 
 
 
407 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  26.81 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  27.59 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  34.44 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  34.83 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.97 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.7 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  35.56 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  39.29 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  26.96 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  36.14 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  25.76 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  33.7 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  32.47 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  35.16 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  35.71 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  36.14 
 
 
127 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>