140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1582 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 146 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1837  phenylacetic acid degradation-related protein  58.82 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  32.06 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.54 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  34.88 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  28.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.56 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.82 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.96 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  31.93 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  32.82 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.78 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  47.44 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.82 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.82 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  28.89 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  33.61 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.4 
 
 		 161 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  29.79 
 
 		 238 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  33.05 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  31.45 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  29.36 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  32.79 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33.05 
 
 		 248 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  33.98 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  32.23 
 
 		 374 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  30.25 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  34.96 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  31.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  33.01 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.03 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>