220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5184 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  61.07 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  61.07 
 
 		 139 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  61.07 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  60.31 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  57.14 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  56.3 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  47.06 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  46.43 
 
 		 139 aa  119  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  39.69 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  40.52 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  38.98 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  37.93 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  42.24 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  40.21 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  35.88 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  31.58 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  32.77 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  31.58 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  30.7 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  30.7 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  29.82 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  29.82 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  29.82 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  29.82 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  29.82 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  32.38 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  32.38 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  29.5 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  35.97 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  32.35 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  32.35 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  31.09 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  31.45 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  33.61 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  33.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.63 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  31.9 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  29.06 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  26.87 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  31.58 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  28.87 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  28.1 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  28.1 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  29.45 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  36.17 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  31.3 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>