272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3890 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  75 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  71.97 
 
 		 132 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  72.73 
 
 		 160 aa  192  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  72.73 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  57.26 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  52.07 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  39.69 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  39.39 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  41.75 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  41.28 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  38.46 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  39.17 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  38.05 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  40.57 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  32.31 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  32.31 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  32.31 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  41.38 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  32.31 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  34.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  34.21 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  32.06 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  37.38 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  42.7 
 
 		 181 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  37.38 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  37.38 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  38.32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  38.32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  38.32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  38.32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  38.32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.38 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.45 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.45 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  36.45 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  32.76 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  33.02 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  33.63 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  35.78 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  32.58 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  31.75 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.32 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  28.24 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  32.74 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  34.4 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.71 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  29.32 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  30.7 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  29.32 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  31.19 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>