270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2937 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  92.42 
 
 		 160 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  80.3 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  75 
 
 		 132 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  71.97 
 
 		 133 aa  193  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  53.72 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  43.33 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  38.97 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  37.93 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  37.1 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  40.78 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  38.26 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  35.34 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  37.96 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  37.96 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  37.96 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  37.96 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  37.96 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  37.96 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  37.96 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  37.96 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  31.53 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  31.53 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  31.53 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  37.04 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  31.78 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  31.53 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  36.94 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  33.33 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  35.85 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  39.08 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  34.78 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  32.5 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  36.94 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  31.93 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  36.7 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  29.75 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  29.75 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  30.1 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  34.19 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  33.04 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  29.55 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  34.19 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  27.73 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>