More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2351 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  62.68 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  46.56 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  45.11 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  41.35 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  46.22 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  37.8 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.15 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.53 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.02 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.2 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.67 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.06 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.59 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.4 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.94 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.98 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.18 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.34 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.43 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.38 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.07 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.43 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.4 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  38.05 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  37.3 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.96 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.25 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.53 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  37.6 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.18 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.48 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.38 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.6 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.51 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.6 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.8 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.6 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.7 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.7 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.6 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.1 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.45 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  40.74 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  35.71 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.41 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.2 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.2 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.44 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.93 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  39.81 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  39.81 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  39.81 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.61 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.13 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  34.62 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.07 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.7 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.75 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.18 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  35.65 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  30.71 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  31.36 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.42 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  32.2 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  30.51 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.34 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.86 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  31.36 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>