126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1079 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  283  5.999999999999999e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  43.18 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  40.34 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.72 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.72 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.72 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.72 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  38.71 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  35.4 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.84 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.66 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.29 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.65 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.23 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.59 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  37.61 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.32 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.46 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  32.09 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.61 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.07 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.75 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  37.1 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  37.39 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.61 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.79 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  35.4 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.79 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  31.53 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.21 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  35.71 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.93 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.83 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  32.17 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.05 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.93 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.42 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.6 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.97 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.58 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.96 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.65 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.65 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.46 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.88 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.4 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.79 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.37 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.37 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  31.06 
 
 		 251 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.35 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.63 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.63 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.19 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.33 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.89 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.72 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.78 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.78 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  36.84 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.71 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.46 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.89 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.77 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.63 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  31.13 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.21 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.83 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>