107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1126 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  33.53 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  29.38 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  31.39 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  35.87 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  33.64 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  30.77 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
131 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
136 aa  60.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  26.9 
 
 
226 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
157 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
157 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  26.39 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
223 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  27.39 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  27.42 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  31.16 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  30.16 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  28.18 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
210 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  25.89 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  26 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  28.81 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  26 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  28.3 
 
 
209 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
208 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
208 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.78 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
219 aa  43.9  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  23.31 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.76 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.71 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  35.44 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.77 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  24.73 
 
 
226 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.94 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
158 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
159 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 
160 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0899  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
150 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0605625  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  29.47 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  25.93 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  25 
 
 
318 aa  41.2  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  27 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  32.98 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>