43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2155 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
160 aa  331  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  86.62 
 
 
161 aa  292  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  56 
 
 
159 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  55.7 
 
 
158 aa  175  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  56.13 
 
 
154 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  51.66 
 
 
166 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  55.33 
 
 
157 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
156 aa  161  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  51.68 
 
 
159 aa  150  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  45.06 
 
 
165 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  49.36 
 
 
150 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  49.38 
 
 
164 aa  141  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  45.81 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 
151 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  37.82 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  34.9 
 
 
170 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  65.62 
 
 
200 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  35.95 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  39.2 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  38.19 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  38.19 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  38.19 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  28.86 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  32.12 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  32.65 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 
226 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  24.31 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
225 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  35.35 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  24.76 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
182 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>