35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4172 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  55.45 
 
 		 226 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  53.23 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 		 136 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  39.24 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  35.8 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 175 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 131 aa  52  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  35.63 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 167 aa  48.5  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  28.05 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  26.26 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>