70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2382 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 157 aa  326  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  75.16 
 
 		 156 aa  253  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  71.24 
 
 		 154 aa  236  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  53.74 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  54.14 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  57.05 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  56.29 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  47.74 
 
 		 165 aa  168  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  55.33 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  49.32 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  44.37 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  45.45 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  48.32 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  46.98 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  44.44 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  67.19 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  41.3 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  42.22 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  41.48 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  42.22 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  33.04 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  34.21 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 204 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  30.32 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  26.49 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  26.49 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  40 
 
 		 226 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  32.04 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 215 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 223 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>