60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8681 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 151 aa  313  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  88.74 
 
 		 151 aa  251  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  47.65 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  46.36 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  45.64 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  48.32 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  47.4 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  52.7 
 
 		 159 aa  136  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  46.41 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  43.44 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  39.84 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  38.13 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  39.02 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  36.09 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  30.41 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  43.08 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  29.1 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  28.99 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  27.97 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  32.82 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  26.09 
 
 		 170 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>