28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1093 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  61.6 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  51.97 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  94.12 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  33.58 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  32.56 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  53.7 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  42.11 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  37.93 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  42.11 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  40.35 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  40.35 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>