48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3840 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  82.49 
 
 
209 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  69.8 
 
 
208 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  70.65 
 
 
208 aa  286  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  70.65 
 
 
208 aa  286  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  44.5 
 
 
218 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  40.69 
 
 
209 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
215 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
214 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
215 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
215 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  42.93 
 
 
189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  35.12 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  33.16 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  29.78 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  28.65 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  32.81 
 
 
318 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  29.95 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2595  hypothetical protein  30.15 
 
 
155 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000992118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
162 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  28.96 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 
162 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
190 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  29.2 
 
 
124 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  32.79 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  32.95 
 
 
134 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  34.65 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  29.27 
 
 
316 aa  45.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31999  predicted protein  27 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  37.66 
 
 
145 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
164 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  29.79 
 
 
149 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>