201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0015 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0015  aromatic compounds catabolism protein  100 
 
 
124 aa  246  7e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0886  thioesterase superfamily protein  52.03 
 
 
124 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1857  aromatic compounds catabolism protein  37.6 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 
129 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  37.72 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  38.26 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  35.83 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  35.04 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  35.09 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  34.96 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  33.33 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  34.43 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  34.43 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  34.43 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  34.43 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  34.43 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  31.9 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  33.6 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  29.84 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  33.6 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  34.43 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  34.43 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  35.79 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  35.14 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  34.43 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  33.61 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  35.14 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  29.75 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  38.26 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  35.65 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  29.75 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  37.39 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  35.65 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.13 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  30.77 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  33.91 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  31.03 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  35.65 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  31.37 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  34.02 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0870  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  36.52 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  33.62 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  33.62 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  32.41 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  28.16 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  32.17 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  29.7 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  29.7 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  29.7 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  29.7 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  29.7 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>