19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3833 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3833  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 174 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  28.06 
 
 		 169 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 148 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 159 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 182 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.74 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 179 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  23.74 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  23.74 
 
 		 176 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 189 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  31.76 
 
 		 169 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>