109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0048 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 124 aa  249  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.28 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0220085  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  30.39 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  29.63 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  29.63 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  28.85 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  28.85 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  28.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  28.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  28.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  28.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  28.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  24.27 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  24.27 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  28.85 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  24.58 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  24.75 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  27.88 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  27.88 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  27.88 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  26 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  28.44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  28.44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  28.44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  25.24 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  25.49 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  30.21 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  31.37 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  20.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  30.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  30.85 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  30.56 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  25.25 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  30.85 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  27.84 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 147 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  24.77 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  24.77 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  24.77 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  24.77 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  25 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  27.84 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  29.36 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.42 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  27.84 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  27.84 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  25.69 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  24.77 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  25.69 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  26.17 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  24.53 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  26.8 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>