95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1543 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  100 
 
 
139 aa  290  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
130 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.59 
 
 
128 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  43 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  46.24 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  43.16 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  43 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  43.01 
 
 
142 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  49.28 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  40.66 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  31.53 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  31.53 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  29.91 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
292 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  32.04 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  32.48 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  36.46 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  32.67 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.16 
 
 
285 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.33 
 
 
145 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  30.08 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.67 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  27.18 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.31 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  23.89 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  22.94 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  22.94 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4044  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  32.84 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.91 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.73 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.63 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  26.61 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  27.55 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
132 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  23.93 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  25.84 
 
 
289 aa  40.8  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  25.26 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  26.67 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.68 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
163 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
129 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
163 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>