141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0143 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 138 aa  286  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  81.68 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  79.69 
 
 		 138 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  78.12 
 
 		 142 aa  210  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  74.22 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  70.54 
 
 		 132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  67.42 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 		 134 aa  166  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  61.54 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.03 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  43.16 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  37.4 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  37.4 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  33.06 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  32.5 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  32.26 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  27.69 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  27.13 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  30.4 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.21 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  30.65 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.93 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2560  hypothetical protein  27.27 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2613  hypothetical protein  27.27 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1023  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  30.12 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00412471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.89 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.12 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.69 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  32.22 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  28.92 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  34.29 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  28.68 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.42 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  34.29 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  34.29 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.45 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  29.32 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11021  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  28.92 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0792873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.46 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.21 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.43 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  25.76 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.26 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  24.31 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  29.87 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.27 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.65 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  23.96 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  36.07 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>