87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2729 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 149 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  83.8 
 
 		 145 aa  255  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  83.1 
 
 		 145 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  80.85 
 
 		 153 aa  246  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  81.56 
 
 		 153 aa  243  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  78.87 
 
 		 144 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  78.87 
 
 		 144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  78.87 
 
 		 144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  78.17 
 
 		 144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  80.14 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  75.61 
 
 		 130 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  51.77 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  47.22 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  47.55 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  48.91 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  42.45 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.58 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  32.52 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  32.82 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  32.06 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.91 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  33.04 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  29.55 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.54 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.11 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  25 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  27.73 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.07 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.03 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.23 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  27.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.89 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25.37 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  25.17 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 139 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  26.17 
 
 		 318 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 		 132 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  36.76 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.83 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 141 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 134 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.07 
 
 		 134 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>