135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0104 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  295  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  84.5 
 
 		 139 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  78.12 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  75.97 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  77.34 
 
 		 141 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  67.97 
 
 		 132 aa  184  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  69.75 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  57.48 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  59.38 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  53.27 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.56 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  43.01 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  33.59 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  35 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  31.2 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  28.79 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.91 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  35.53 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  35.53 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.75 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2560  hypothetical protein  27.37 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2613  hypothetical protein  27.37 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  35.53 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  28.91 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.79 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  28.91 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.85 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.48 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  29.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 165 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  25.19 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  37.31 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  30.08 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  25.95 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  27.96 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  25.21 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.86 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.87 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.73 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  25.21 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  23.93 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1853  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107665  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.31 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  31.33 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  26.14 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.03 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  25.29 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 132 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  28.41 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  27.38 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  26.73 
 
 		 138 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.11 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>