120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3780 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  98.61 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  97.22 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  85.82 
 
 		 153 aa  259  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  84.03 
 
 		 145 aa  254  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  84.03 
 
 		 145 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 153 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  83.69 
 
 		 153 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  78.87 
 
 		 149 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  75.2 
 
 		 130 aa  189  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  50 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  48.59 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  49.3 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 156 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  39.86 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  34.31 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  33.05 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  33.85 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  30.89 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.66 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.13 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  27.48 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.65 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  30.47 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  29.01 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.85 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.27 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  26.67 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  28.8 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 283 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.08 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  29.13 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  20 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  20 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  34.43 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  28.46 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  27.12 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.2 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.21 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  30.23 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  30.23 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  30.23 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  30.23 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  30.23 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  30.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  30.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  24.19 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.27 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  25.42 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  29.58 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>