55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03750 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  37.31 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  35.11 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  35.16 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  33.05 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  33.07 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  28.06 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  28.24 
 
 		 164 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  27.34 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  31.71 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  30.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  29.92 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  32.63 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  25.98 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  19.84 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.17 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  23.02 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  23.02 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  21.97 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  22.9 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.88 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.88 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.19 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  30.39 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  26.4 
 
 		 252 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  24.76 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  28.32 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>