127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2002 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  97.24 
 
 
145 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  85.42 
 
 
144 aa  256  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  83.8 
 
 
149 aa  255  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 
144 aa  255  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  84.03 
 
 
144 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  84.03 
 
 
144 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  84.4 
 
 
153 aa  253  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 
153 aa  243  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  82.27 
 
 
153 aa  239  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  68.75 
 
 
130 aa  188  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 
154 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  52.45 
 
 
158 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  51.09 
 
 
162 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  50.38 
 
 
164 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  50.36 
 
 
164 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
156 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  44.85 
 
 
140 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
158 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.58 
 
 
140 aa  103  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  33.07 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  33.59 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  32.06 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.23 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.18 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  28.24 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.26 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  33.04 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  32.58 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.65 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.15 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.41 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.77 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.02 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  28.81 
 
 
318 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  26.05 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  30.19 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  30.77 
 
 
255 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
149 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 
139 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.54 
 
 
136 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  30.16 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  30.16 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.81 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  26.87 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  26.23 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
283 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.87 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25.2 
 
 
252 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.56 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.62 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  25.78 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  28.69 
 
 
246 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  22.86 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  22.22 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  22.22 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.07 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  24.14 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  27.97 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  28.04 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>