161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0077 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 138 aa  290  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  93.33 
 
 		 136 aa  266  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  91.85 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  92.48 
 
 		 136 aa  261  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  92.48 
 
 		 136 aa  261  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  91.11 
 
 		 136 aa  259  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  91.11 
 
 		 136 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  91.11 
 
 		 136 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  91.73 
 
 		 136 aa  257  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  72.18 
 
 		 134 aa  206  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 134 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  71.65 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  64.62 
 
 		 155 aa  190  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  65.41 
 
 		 135 aa  190  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  63.16 
 
 		 134 aa  190  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  63.16 
 
 		 134 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  52.59 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 		 135 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  42.28 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  43.8 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  43.8 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  43.8 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  38.52 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  42.28 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  41.8 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  24.44 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  24.81 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  28.46 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.31 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.54 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  25.98 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  26.55 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0960  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  27.48 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  31.34 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 283 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.84 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0557  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  23.81 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  28.95 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  28.95 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  25.98 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  24.39 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.4 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>