64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2020 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  65.9 
 
 
172 aa  220  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  62.71 
 
 
183 aa  210  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  61.36 
 
 
175 aa  210  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  50.57 
 
 
200 aa  170  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
190 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  32.89 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  31.94 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  31.79 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  31.54 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  35.85 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  32.67 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  30.64 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  32 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  32.85 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  30.64 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  30.64 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  31.03 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  30.64 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  32.45 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  29.31 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  35.1 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  30.66 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  33.11 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  33.75 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  31.65 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  26.25 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  33.55 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  31.47 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  29.93 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  32.5 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  27.4 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  28 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  26.85 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  26.43 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
172 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  33.12 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  24.54 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  38.03 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
180 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  24.36 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
142 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  30.59 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
132 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
135 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  41.6  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  28.95 
 
 
135 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>