66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2568 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  364  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  36.42 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  35.59 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  37.93 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  36.99 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  34.1 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  33.9 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  37.08 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  35.84 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  36.42 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  32.68 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  25.9 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  26.88 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  30.38 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  27.98 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  25.61 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  27.14 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  25.33 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  36.08 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  27.59 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  27.33 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  27.95 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  27.95 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  27.95 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  26.49 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  24.38 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  27.33 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  25.47 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  26.09 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  26.29 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  25.49 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  22.73 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  24.43 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  22.52 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 132 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  29.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  29.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  29.46 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  20 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 132 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>