49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0126 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  88.64 
 
 
176 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  81.82 
 
 
176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  81.25 
 
 
176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  81.25 
 
 
176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  81.71 
 
 
176 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  80.11 
 
 
176 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  81.25 
 
 
176 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  81.25 
 
 
176 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  80.68 
 
 
176 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  80.68 
 
 
176 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  81.25 
 
 
190 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  78.86 
 
 
197 aa  298  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  75.57 
 
 
178 aa  286  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  72.16 
 
 
176 aa  286  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  78.66 
 
 
176 aa  284  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  42.53 
 
 
178 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  37.86 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  33.11 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  30.5 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  40.17 
 
 
181 aa  87.8  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
181 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  34.16 
 
 
200 aa  84.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  29.52 
 
 
176 aa  84.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
190 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  31.43 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  28.19 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  28.14 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  28.66 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  28.93 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  30.14 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  29.17 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  27.81 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  27.75 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  27.17 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  33.93 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  29.7 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  29.38 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  29.38 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  29.5 
 
 
236 aa  61.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10158  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 
343 aa  52.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  24.24 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  22.52 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 
306 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  28.04 
 
 
215 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>