24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0640 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  60.87 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  57.61 
 
 
184 aa  221  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  33.93 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  32 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  31.69 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  27.74 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  32.35 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  33.62 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  32.77 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  32.52 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  32.52 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  30.47 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  30.47 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  30.47 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  30.23 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  30.23 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  27.87 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  22.5 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  23.67 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>