36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0546 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  391  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  84.49 
 
 
184 aa  334  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  60.87 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  31.58 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  31.11 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  29.65 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  29.65 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  29.65 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  35.78 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  29.38 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  33.94 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  30.63 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  28.9 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  28.49 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  28.49 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  28.49 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  28.49 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  23.81 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  27.01 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  28.83 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  21.25 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  25.19 
 
 
181 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  24.31 
 
 
172 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  23.21 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  23.61 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  23.65 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  23.42 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  21.13 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  22.01 
 
 
193 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  21.13 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  22.22 
 
 
175 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  20.39 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>