69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1459 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
200 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  67.82 
 
 
175 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  55.25 
 
 
183 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  52.91 
 
 
172 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  50.57 
 
 
176 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  35.67 
 
 
181 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  37.16 
 
 
181 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  30.9 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  32.93 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  31.48 
 
 
190 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  36.36 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  32.19 
 
 
176 aa  85.1  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  34.16 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  31.47 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  30.19 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  30.32 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  31.72 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  29.33 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  30.63 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  32.92 
 
 
176 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  30.97 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  29.03 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  29.93 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  33.75 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  30.37 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  29.87 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  31.67 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
172 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  28.47 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  24.5 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  24.03 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  27.78 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  25.83 
 
 
136 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
147 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 
136 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
147 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  24.71 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  28.75 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
132 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  31.96 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  27.07 
 
 
133 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  29.7 
 
 
139 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
161 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
157 aa  41.2  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
148 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>