47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0020 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  37.8 
 
 
181 aa  104  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  30.43 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  39.29 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  36.36 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  32.95 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  30.06 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  30.61 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  34.69 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  34.69 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  34.01 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  34.01 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  37.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  30.66 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  28.93 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  30.23 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  31.54 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  27.89 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  30.64 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  32.77 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  29.27 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  29.45 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  30.63 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  30.19 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  30.71 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  25.93 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  27.82 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  30.67 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  28.95 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2476  thioesterase-like protein  28.24 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.420578  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
138 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  31.13 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 
200 aa  44.3  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  24.3 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  32.84 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
138 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>