54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1329 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 157 aa  328  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  40.26 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  25.38 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  33.96 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  29.32 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  26.28 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  29.2 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 176 aa  43.9  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  25 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  26.36 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  23.4 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  24.26 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  32.79 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  32.94 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.4 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.4 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.48 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>