251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3160 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
180 aa  361  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
131 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  24.84 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  29.93 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  32.12 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  25.68 
 
 
150 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 
136 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  25.68 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
148 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  23.81 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
139 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
154 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.34 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  32.12 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  31.54 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  25.34 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 
288 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
135 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
137 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
151 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.57 
 
 
134 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  29.05 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  25.34 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
142 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
163 aa  54.3  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 
285 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
139 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
289 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
140 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 
286 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
142 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
145 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  32.82 
 
 
151 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
146 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
137 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  24.65 
 
 
156 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  30.67 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
283 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  23.29 
 
 
140 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
145 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.74 
 
 
144 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
132 aa  51.2  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
145 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  24.29 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  24.29 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  25.2 
 
 
129 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  33.33 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
292 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  30.5 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
289 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.19 
 
 
134 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>