45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0029 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  98.29 
 
 		 176 aa  347  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  82.76 
 
 		 175 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  59.43 
 
 		 190 aa  210  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  55.37 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  50.57 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  56 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  37.78 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  36.11 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  36.99 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  37.5 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  39.46 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  30.32 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  37.69 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  32.33 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  33.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  32.64 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  32.35 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  29.52 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  28.05 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  29.27 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  27.75 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  28 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  28.1 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  27.71 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  28.31 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  22.39 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  21.13 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>