40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33198 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  100 
 
 
215 aa  447  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  36.08 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  31 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  29.09 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  29.49 
 
 
190 aa  55.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  27.34 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 
170 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  26.72 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  24.53 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  32.41 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  28.3 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
138 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  30.65 
 
 
176 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  31.48 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  31.48 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  31.48 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  25.55 
 
 
175 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  27.34 
 
 
192 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  35.29 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
138 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  29.11 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  28.04 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  29.92 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  26.67 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  30.38 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  28.18 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  27.03 
 
 
175 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  29.07 
 
 
190 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  26.45 
 
 
136 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>