33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34859 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10158  conserved hypothetical protein  37.95 
 
 
343 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  32 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  30.67 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  29.45 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  28.65 
 
 
176 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  28.65 
 
 
176 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  28.07 
 
 
176 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  28.77 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  29.5 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  25.95 
 
 
175 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  29.33 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  25 
 
 
183 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 
172 aa  55.1  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  28.06 
 
 
178 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  24.67 
 
 
170 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  24.09 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  25.48 
 
 
159 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  23.53 
 
 
175 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  20.25 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  31.31 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  23.08 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  21.18 
 
 
180 aa  41.6  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>