49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3168 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  39.68 
 
 
253 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  40.32 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  33.46 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  33.46 
 
 
246 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  33.6 
 
 
246 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  31.52 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  30.15 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  30.74 
 
 
318 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  31.15 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  30.47 
 
 
254 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  30 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  28.74 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  26.75 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  29.22 
 
 
255 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  28.34 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  30.09 
 
 
252 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  29.77 
 
 
238 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  27.12 
 
 
244 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  23.48 
 
 
252 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  25.83 
 
 
247 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  28.44 
 
 
243 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  25.82 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  29.25 
 
 
237 aa  98.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  27.71 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  27.73 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  28.15 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  28.44 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  26.46 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  27.62 
 
 
249 aa  88.6  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  24.64 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  26.19 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  21.85 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  23.33 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  24.29 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  27.87 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  27.78 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  25.35 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  19.57 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
135 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  21.51 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.08 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
130 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  25.14 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25 
 
 
130 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  22.13 
 
 
163 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
136 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  22.99 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>