25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2228 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  42.96 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  40.74 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  39.71 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  37.06 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  37.06 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  36.3 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  39.42 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  36.91 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  36.91 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  35.92 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  37.96 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  36.15 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  37.68 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.35 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  22.58 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  25.58 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  22.56 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 145 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>