29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0454 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  68.89 
 
 
142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  59.7 
 
 
147 aa  174  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  58.96 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  51.77 
 
 
142 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  53.33 
 
 
141 aa  147  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  52.99 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  45.26 
 
 
143 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  43.57 
 
 
141 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
145 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  41.43 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  40.71 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  40.71 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  36.88 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  37.86 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  34.07 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  41.18 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  53.62 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  29.85 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  22.76 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  21.09 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  22.31 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
291 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  21.8 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>